由于中方科學(xué)家另辟蹊徑解決了研究瓶頸,9月23日,由14國(guó)科學(xué)家組成的“國(guó)際馬鈴薯基因組測(cè)序協(xié)作組”在北京、阿姆斯特丹和紐約等地同時(shí)宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成?! ≡擁?xiàng)目由荷蘭瓦赫寧根大學(xué)發(fā)起,2006年正式啟動(dòng)。中國(guó)農(nóng)科院副院長(zhǎng)屈冬玉博士作為項(xiàng)目發(fā)起人之一,組建了由農(nóng)科院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院的專家組成的中方團(tuán)隊(duì)。
2006年—2008年底,國(guó)際協(xié)作組遇到了基因組高度雜合、物理圖譜質(zhì)量不高、測(cè)序成本高等難以克服的困難。此時(shí),中方首席科學(xué)家黃三文博士提出了一套新的策略:以單倍體馬鈴薯為材料來降低基因組分析的復(fù)雜度,并采用快捷的全基因組鳥槍法策略和低成本的新一代DNA測(cè)序技術(shù)。這一策略的改變,不僅大大提高了整個(gè)聯(lián)盟的進(jìn)程,提前兩年達(dá)到既定目標(biāo),且促使中國(guó)團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)了從參與到主導(dǎo)的過程。
馬鈴薯基因組有12條染色體,8.4億個(gè)堿基對(duì)。該框架圖覆蓋了95%以上的基因。深圳華大的新一代DNA測(cè)序技術(shù)和新的基因組拼接軟件在項(xiàng)目中發(fā)揮了關(guān)鍵作用,使基因組測(cè)序的成本和時(shí)間都減少到原來的1/10。
了解馬鈴薯基因組序列,將幫助科學(xué)家從分子水平了解馬鈴薯是如何生長(zhǎng)、發(fā)育和繁殖的,從而有助于提高馬鈴薯的產(chǎn)量、品質(zhì)和抗病性,更重要的,是將加速馬鈴薯新品種的培育,使其原本需要10—12年的育種過程縮短至5年左右。因此,參與國(guó)際馬鈴薯基因組測(cè)序計(jì)劃,使我國(guó)直接進(jìn)入了馬鈴薯遺傳育種研究的第一方陣,為培養(yǎng)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的優(yōu)良品種打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。 |
|