由于中方科學家另辟蹊徑解決了研究瓶頸,9月23日,由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”在北京、阿姆斯特丹和紐約等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成?! ≡擁椖坑珊商m瓦赫寧根大學發起,2006年正式啟動。中國農科院副院長屈冬玉博士作為項目發起人之一,組建了由農科院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院的專家組成的中方團隊。
2006年—2008年底,國際協作組遇到了基因組高度雜合、物理圖譜質量不高、測序成本高等難以克服的困難。此時,中方首席科學家黃三文博士提出了一套新的策略:以單倍體馬鈴薯為材料來降低基因組分析的復雜度,并采用快捷的全基因組鳥槍法策略和低成本的新一代DNA測序技術。這一策略的改變,不僅大大提高了整個聯盟的進程,提前兩年達到既定目標,且促使中國團隊實現了從參與到主導的過程。
馬鈴薯基因組有12條染色體,8.4億個堿基對。該框架圖覆蓋了95%以上的基因。深圳華大的新一代DNA測序技術和新的基因組拼接軟件在項目中發揮了關鍵作用,使基因組測序的成本和時間都減少到原來的1/10。
了解馬鈴薯基因組序列,將幫助科學家從分子水平了解馬鈴薯是如何生長、發育和繁殖的,從而有助于提高馬鈴薯的產量、品質和抗病性,更重要的,是將加速馬鈴薯新品種的培育,使其原本需要10—12年的育種過程縮短至5年左右。因此,參與國際馬鈴薯基因組測序計劃,使我國直接進入了馬鈴薯遺傳育種研究的第一方陣,為培養具有自主知識產權的優良品種打下了堅實基礎。 |
|